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OHDSI 오픈 소스를 컴파일 하고 배포할때 많은 예외사항들이 발생한다. WebAPI 2.11.0 버전으로 변경하기 위해 컴파일을 하고 배포하려는데 쉽지가 않다. 참조 라이브러리도 많고 곳곳에서 오류가 있다고 로그를 띄운다. 관련 문제와 나왔던 오류를 기록한다. 컴파일 및 배포환경 Red Hat Linux release 8.4(Ootpa) WebAPI 2.11.0 jdk-11.0.15.1 tomcat9 오류내용 Unable to make field private static volatile java.net.URLStreamHandlerFactory java.net.URL.factory accessible: module java.base does not "opens java.net" to unnamed m..

CDM 6.0, Atlas(WebAPI) 2.7.6 을 적용하여 환경구성을 하고 Cohort 실행시 아래와 같은 오류가 발생한다. CDM 5.3버전을 사항하면 문제가 없었으나 이러한 문제외에도 다양한 오류가 발생된다. OHDSI 사이트에서도 2020년 4월 9일 현재 공식적으로 CDM 6.0을 지원하지 않고 있다. 다음과 같은 오류가 발생되는 경우 Foreign Key를 재생성하여 문제를 해결할 수 있다. -- Atlas에서 코호트 생성시 참조키 오류 발생하는 부분 수정 alter table {results_schema}.cohort drop CONSTRAINT fpk_cohort_definition; alter table {results_schema}.cohort add CONSTRAINT fpk_co..

증상 : ATLAS Chort Generator후 Report가 보이지 않는 경우 Achilles R 분석후 "achilles_results"가 존재하지 않아 발생하는 오류 원인 : results 스키마에 테이블이 생성되지 않음 해결방법 : 1. results schema 테이블 생성 1-1. 브라우져에서 아래 URL로 Script를 가져옵니다. http://서버주소:8080/WebAPI/ddl/results?dialect=postgresql&schema=results스키마&vocabSchema=cdm사전스키마&tempSchema=Temp스키마&initConceptHierarchy=true 1-2. 결과 화면에 보이는 스크립트를 복사합니다. 1-3. PgAdmin또는 SQL을 실행할 수 있는 툴에서 re..

OHDSI Achilles 설치시 where 구문오류나는 경우 PostgreSQL 사용중 where 오류입니다. 조치방법 : R을 실행하고 아래 명령어를 실행합니다. >library(devtools)>install_github("ohdsi/Achilles", repos="http://cran.rstudio.com/", ref="v1.5.0") DBMS:postgresql Error:org.postgresql.util.PSQLException: 오류: 구문 오류, "where" 부근 Position: 461 SQL:insert into results.ACHILLES_results_derived (statistic_value,stratum_1,measure_id)select CAST(100.0*st.val/..